溫度是氣相色譜分析的重要操作參數之一。它直接影響著色譜柱的選擇性，分離度以及檢測器的基線穩定性。由于汽化室，色譜柱和檢測器各自有不同的作用。因此，在色譜分析中亦有三種不同溫度變數的操作以及相應的三種各自的溫度控制器。除此之外，還有其他附加設備如熱電偶的冷端補償，超溫保護等。

溫度控制的基本原理就是使恒溫箱散失的熱量能及時的由適量的熱源來補充。當供給和失去的熱量平衡時，溫度就維持在一個恒溫點上。根據這一要求，他可以通過不同的方法來實現。在氣相色譜儀上主要是采用電加熱控制法。溫控對象是裝有色譜柱的爐膛。色譜爐的四壁使用優質保溫材料來隔熱。常用的保溫材料有：玻璃棉或氈，陶瓷纖維棉或氈，膨脹珍珠巖保溫塊，石膏玻璃棉復合材料保溫塊等。為了保證爐膛內溫度均勻，普遍采用電風扇，強制空氣對流，以消除爐膛內的溫度梯度。

色譜爐由電熱絲加熱，爐內溫度由鉑電阻檢測送至溫控電中路與設定溫度比較。如果爐內溫度低于設定溫度，則溫控電路輸出信號使電熱絲獲得加熱功率，當供給和失去的熱量相等時，即可實現恒溫控制結果。

一般來講，一個已知電加熱絲阻值R₂的色譜爐，要想產生不同的熱量即控制不同的溫度，可以改變通過加熱絲的電流（I）值或改變通過加熱絲電流的時間（t）來實現。根據這兩種電功率控制的不同方式，在氣相色譜儀中就有相應的兩種溫控線路：通斷式溫控線路和連續式溫控電路。